Výkonná rada
Výkonná rada agentúry je orgánom vykonávajúcim zásadné rozhodovanie vo veciach akreditácií formou uznesení a tiež schvaľuje základné dokumenty. Jej zloženie priamo ovplyvňujú reprezentácie vysokých škôl priamou nomináciou a predstavitelia zamestnávateľských združení. Menuje ich minister školstva.
Predseda výkonnej rady je štatutárnym zástupcom a je vyberaný výberovým konaním.
Predseda výkonnej rady
prof. Ing. Robert Redhammer, CSc.
Podpredseda výkonnej rady
prof. RNDr. René Matlovič, PhD.
Členovia výkonnej rady
prof. dr. MA Július Horváth, PhD.
prof. RNDr. František Kačík, PhD.
Ing. Viliam Kupec, PhD.
Mgr. art. Bálint Lovász
prof. PaedDr. Vladimír Patráš, CSc.
prof. MUDr. Iveta Šimková, CSc.
prof. JUDr. Ivan Šimovček, CSc.
Vedúci kancelárie
Vedúci kancelárie je v zmysle zákona orgánom agentúry, zabezpečuje riadny chod agentúry, t. j. zabezpečuje administratívne, technické, priestorové a materiálne podmienky pre činnosť agentúry.
Ing. Dušan Faktor, PhD.
Odvolacia komisia
Členovia komisie agentúry pre posudzovanie námietok:
Dr. h. c. prof. doc. JUDr. Marek Šmid, PhD., predseda
prof. Ing. Jozef Mihok, PhD.
JUDr. Peter Štrpka, PhD.
JUDr. Marcel Jurko, PhD.
Mgr. Roman Oleksik, LL.M.
Náhradníci:
prof. JUDr. Margita Prokeinová, PhD.
Kontrolór
Ing. Ivan Hargaš
